Cancer Genomics

Målet med kurset er å gi deltakerne teoretisk og praktisk kunnskap om genomskala-analyser av genforandringer i pasientprøver og i eksperimentelle modeller. Kurset vil fokusere på ulike metoder basert på "dyp-" eller "nestegenerasjonsekvensering", NGS, av RNA og DNA i svulster og normalprøver. Også analyser av kromatinets og kjernens struktur blir forelest, samt etiske og juridiske forhold og arvelig kreftpredisposisjon.

Anbefales som del av opplæringsdelen for ph.d.-kandidater knyttet til Forskerskolen til CCBIO.

Etter å ha fullført kurs, skal kandidatene ha:

Kunnskap om

• Hvilke typer mutasjoner som skjer under eller kan predisponere for kreftutvikling.
• Hvordan disse kan påvises med NGS-metoder og analyseres bioinformatisk.
• Hvordan mutasjonsanalyse kan brukes til stratifisering av pasienter både diagnostisk og terapeutisk.
• Ulike konsekvenser av gitte mutasjoner i ulike celletyper.
• Etiske og juridiske regler for genetiske analyser av pasientmateriale.

Ferdigheter

• Kunne formulere problemstillinger, velge metoder og planlegge for gjennomføring av NGS-analyser på pasientprøver.
• Kunne vurdere nytte og begrensinger ved bruk av NGS-metoder i diagnostikk og kreftforskning.
• Kjenne til hvilke kontaktpunkter som finnes for NGS i Bergen.
• Kunne formilde relevant litteratur og metoder for kreftgenomikk.

Generell kompetanse

• Kunne vurdere hvordan kunnskap om mutasjoner kan føre til økt kunnskap om tumorbiologiske mekanismer, bedre og mer presis diagnose og til målrettet behandling og oppfølging av kreftpasienter.

Fire fulle dager med forelesninger og seminar

Gruppearbeid med diskusjon og individuell presentasjon

Litteratur: se obligatorisk pensum under

Program kan leses her:

Program for høsten 2023