Kort info
Forskning
Jeg er forsker ved Senter for dyphavsforskning, tilknyttet Institutt for geovitenskap, hvor jeg har ulike ansvarsområder.
Jeg jobber i geomikrobiologi-gruppen til Steffen Jørgensen ved Senter for dyphavsforskning. Min forskning er rettet mot å forstå de mikrobielle samfunnene som lever i dyphavssedimenter. I disse miljøene står det enorme antallet celler i sterk kontrast til den lille mengden energi som er tilgjengelig for vekst. Cellene forventes å vokse i et ekstremt sakte tempo, noe som gjør studier av samfunnsdynamikk svært utfordrende. Ved å kvantifisere de ulike funksjonelle mikrobielle gruppene gjennom sedimentkjerner prøver vi å forstå hvordan kjemiske endringer kan påvirke de mikrobielle strukturene.
Forskningen min strekker seg også til andre felt. De siste årene har jeg jevnlig vært på øya Milos (Hellas) for å studere det grunne hydrotermale systemet. Gjennom samarbeid har jeg også hatt muligheten til å bruke mine bioinformatikk- og biostatistikk-kompetanser innen ulike felt som mikrobiologi i dyremager, mikrobiologi i museumssamlinger og matematisk økologi.
Siden 2021 har jeg også hatt ansvar for geomikrobiologi-laboratoriet. I denne rollen har jeg med suksess ledet Norges første My Green Lab-sertifisering av et offentlig laboratorium.
Litt mer om meg:
Jeg kommer fra Bretagne, på den vestlige enden av Frankrike (nær landsbyen til Asterix og Obelix!). Opprinnelsen min har hatt stor innflytelse på hobbyene mine: Jeg spiller sekkepipe, driver med fridykking og liker de fleste aktiviteter knyttet til havet. Ikke overraskende har utdanningen min dreid seg rundt marinbiologi, men også miljøvitenskap, virologi og mikrobiologi.
Jeg har vært så heldig å studere i flere land, med starten i Brest (Frankrike) hvor jeg tok en IUT i biologi over to år. Deretter fullførte jeg bachelorgraden min i miljøbiologi i Edinburgh (Skottland). Jeg fortsatte med Erasmus Mundus-masteren i marin biodiversitet og bevaring (EMBC) i Bremen (Tyskland) og Oviedo (Spania). Dette ga meg også muligheten til å gjøre masterprosjektet mitt ved det danske arkeesenteret i København (Danmark). Til slutt flyttet jeg til Norge for å ta doktorgraden min ved Universitetet i Bergen.
Formidling
Postere og muntlige presentasjoner på workshops og konferanser de siste 5 årene:
SmartLab24 2024 (Oslo), CanCell retreat 2024 (Sverige), CodaWork 2024 (Spania), IAMG 2023 (Trondheim), Microenergy workshop 2022 (Danmark), Gordon Research Conference Marine Microbes 2022 (Sveits).
Inntil nylig har jeg hatt ansvar for forskningsformidling og publikumskontakt ved Senter for dyphavsforskning gjennom nettsider, årlige tokt-rapporter og årlige fremdriftsrapporter. I tillegg har jeg hatt ledende roller i formidlings- og bevisstgjøringseventer som Forskningsdagene, Passion for Ocean Day og OPPLEV Marineholmen. Arbeidet mitt har også blitt publisert i populærvitenskapelige medier, som The Conversation (FR).
Undervisning
Publikasjoner
Yen, Y., Weisbjerg, M.R., Abdelhafiz, Y., Le Moine Bauer, S., Kiron V., and Novoa-Garrido, M (2024) Feed characteristics and potential effects on ruminal bacteria of ensiled sugar kelp and winged kelp for Holstein dairy cows. Animal doi.org/10.1016/j.animal.2024.101274
Landor, L.A.I., Stevenson, T., Mayers, K.M.J., Fleming, M.S., Le Moine Bauer, S., Babel, H.R. and Thiele, S. (2024) DNA, RNA, and prokaryote community sample stability at different ultra‐low temperature storage conditions. Environmental sustainability doi.org/10.1007/s42398-023-00297-2
Zhao, R., Le Moine Bauer, S. and Babbin, A.R. (2023) “Candidatus Subterrananammoxibiaceae,” a New Anammox Bacterial Family in Globally Distributed Marine and Terrestrial Subsurfaces. Applied and Environmental Microbiology doi.org/10.1128/aem.00800-23
Le Moine Bauer, S., Lu, G.S., Goulaouic, S., Puzenat, Schouw, A., Barreyre, T., Pawlowsky-Glahn, V., Egozcue J.J., Martelat, J-E., Escartin, J., Amend, J.P., Nomikou, P., Vlasopoulos, O, Polymenakou, P., J., Jørgensen, S.L. (2023) Structure and metabolic potential of the prokaryotic communities from the hydrothermal system of Paleochori Bay, Milos, Greece. Frontiers in Microbiology doi.org/10.3389/fmicb.2022.1060168
Møller, T.E., Le Moine Bauer, S., Hannisdal, B., Zhao, R., Baumberger, T., Roerdink, D. L., Dupuis, A., Thorseth, I.H., Pedersen, R. B., Jørgensen, S. L. (2022) Mapping Microbial Abundance and Prevalence to Changing Oxygen Concentration in Deep-Sea Sediments Using Machine Learning and Differential Abundance. Frontiers in Microbiology doi.org/10.3389/fmicb.2022.804575
Puzenat, V., Escartin, J., Martelat, J-E., Barreyre, T., Le Moine Bauer, S., Nomikou, P., Graccias, N., Allemand, P., Antoniou, V., Coskun, O, Garcia, R., Grandjean, P., Jørgensen, S. L., Magi, L., Mandalakis, M., Orsi, W., Polymenakou, P., Schouw, A., Vallicrosa, G., Vlasopoulos, O. (2021) Shallow-water hydrothermalism at Milos (Greece): Nature, distribution, heat fluxes and impact on ecosystems. Marine Geology doi.org/10.1016/j.margeo.2021.106521
Roalkvam, I., Le Moine Bauer, S. and Powell, M. (2021) Sequencing reveals different nitrifying bacteria in freshwater and seawater RAS biofilters. Hatchery Feed and Management 9
Le Moine Bauer, S., Sjøberg, A.G., L’Haridon, S., Stokke, R., Roalkvam, I., Steen, I.H., Dahle, H. (2019) Profundibacter amoris gen. nov., sp. nov., a new member of the Roseobacter clade isolated from Loki’s Castle Vent Field on the Arctic Mid-Ocean Ridge. International Journal of Systematic Evolution and Microbiology doi.org/10.1099/ijsem.0.003234
Le Moine Bauer, S., Stensland, A., Daae, F.L., Sandaa, R-A., Thorseth, I. H., Steen, I. H., Dahle, H. (2018) Water masses and depth are the major factors structuring prokaryotic and viral communities around hydrothermal systems of the Nordic Seas. Frontiers in Microbiology doi.org/10.3389/fmicb.2018.01002
Dahle, H., Le Moine Bauer, S., Baumberger, T., Stokke, R., Pedersen, R. B., Thorseth, I. H., Steen, I. H. (2018) Energy landscapes in hydrothermal chimneys shape distributions of primary producers. Frontiers in microbiology doi.org/10.3389/fmicb.2018.01570
Wissuwa, J., Le Moine Bauer, S., Steen, I.H., Stokke, R. (2017) Complete genome sequence of Lutibacter profundi LP1T isolated from an Arctic deep-sea hydrothermal vent system. Standards in Genomic Sciences 12 doi.org/10.1186/s40793-016-0219-x
Le Moine Bauer, S., Roalkvam, I., Steen, I.H., Dahle, H. (2016) Lutibacter profundi sp. nov., isolated from a deep-sea hydrothermal system on the Arctic Mid-Ocean Ridge and emended description of the genus Lutibacter. International Journal of Systematic Evolution and Microbiology doi.org/10.1099/ijsem.0.001105
Erdmann, S., Le Moine Bauer, S., Garett, R.A. (2014) Inter-viral conflicts that exploit host CRISPR immune systems of Sulfolobus. Molecular Microbiology doi.org/10.1111/mmi.12503
Erdmann, S., Chen, B., Huang, X., Deng, L., Liu, C., Shah, S.A., Le Moine Bauer, S., Sobrino, C.L., Wang, H., Wei, Y., She, Q., Garett, R.A., Huang, L., Lin, L. (2014) A novel single-tailed fusiform Sulfolobus virus STSV2 infecting model Sulfolobus species. Extremophiles doi.org/10.1007/s00792-013-0591-z